被人类用基因技术(👢)克隆出来的最强宠物小精灵超梦（市村正亲 配(🎎)音）带着对自我(🔸)身份的疑惑和对人类强大的愤怒逃离了科研所，它宣(🈹)布要(🕷)对制造出自己的人类进行复仇。　　(🐖)已(🍬)经得到了八个勋(💡)章的小智（松本梨香 配音），以成为宠物小精灵(👙)训(⏪)练大师为目标而不断的旅行，他带(🤕)着皮(🥎)卡丘(🍙)（大谷育江 配音(🔴)）和同(🏢)伴小霞（饭冢雅弓 配(🔇)音）小刚（上田佑司 配音）刚结(📿)束了和训练家的对战，接(🤹)着收到了一封神秘人的邀请函，邀请他们参(😙)加世上最强的小精灵训练家的宴会。地点是新岛宠物(👹)小精灵城，这是最强训练家的邀请(⛴)。他们很痛快的(🦖)答应(📟)了，小智(🍟)一行人穿过(🎗)了狂风暴雨的海岸终于到(💵)达了新岛。一位叫乔伊的医生带领他们来到了宠物小(🥟)精灵城，介绍最强的宠(🖕)物小精灵训练家出场。没想到出现在大(🦉)家面前的竟然是超梦。超(🐷)梦的报复究竟(🗻)是什么呢(😸)，一场大战即将开始......